Кожен науковий інструмент може бути використаний неправильно та із зловживанням. Наївно було б вважати, що така класифікаційна система, як МКФ, ніколи не буде використовуватися на шкоду для людей. Як пояснюється в Додатку 5, процес перегляду МКУПЖІ включив людей з обмеженням життєдіяльності та їх організації по захисту із самого початку. Їх внесок призвів до суттєвих змін у термінології, змісті та структурі МКФ. 
Цей додаток визначає деякі основні принципи етичного використання МКФ. Очевидно, що жоден набір рекомендацій не може передбачати будь-які форми зловживання класифікацією чи іншим науковим інструментом, або у такому випадку, що рекомендації можуть запобігти неправильному використанню. Цей документ не є винятком. Ми сподіваємось, що увага до положень, що випливають з цього питання, зменшить ризик того, що МКФ буде використовуватися з позицій неуважності та шкоди для людей з обмеженням життєдіяльності.

Повага і конфіденційність
(1) МКФ завжди слід використовувати так, щоб поважати притаманні цінності та автономію окремих осіб.
(2) МКФ ніколи не слід використовувати для позначення людей або іншим чином ідентифікувати їх виключно з точки зору однієї чи кількох категорій обмеження
життєдіяльності.
(3) У клінічних умовах МКФ завжди слід використовувати із загальними знаннями, співпрацею та згодою осіб, чиї рівні функціонування класифікуються. Якщо обмеження індивідуальної когнітивної здатності перешкоджають такій участі, адвокат індивіда повинен бути активним учасником.
(4) Інформація, кодована за допомогою МКФ, повинна розглядатися як персональна інформація та підпадати під дію визнаних правил конфіденційності, придатних для того, яким чином дані будуть використовуватися.

Клінічне використання МКФ
(5) Якщо це можливо, клініцист повинен роз’яснити індивіду або захиснику особи мету використання МКФ та запропонувати питання про доцільність її використання для класифікації рівнів функціонування людини.
(6) По можливості, особа, чий рівень функціонування класифікується (або захисник особи), повинна мати можливість брати участь, зокрема, оскаржити чи підтвердити відповідність використовуваної категорії та призначену оцінку.
(7) Оскільки, класифікований дефіцит є результатом як стану здоров’я людини, так і фізичного та соціального контексту, в якому людина живе, МКФ слід застосовувати цілісно.

Соціальне використання інформації МКФ
(8) Інформація МКФ повинна використовуватися в максимально можливому ступені з допомогою співробітництва окремих осіб для покращення їх вибору та контролю над їхнім життям.
(9) Інформація МКФ має використовуватися для розробки соціальної політики та політичних змін, спрямованих на посилення та підтримку участі окремих осіб.
(10) МКФ, а також вся інформація, отримана внаслідок її використання, не повинна використовуватися для відмови від встановлених прав або іншим чином обмежувати
законні права на пільги для окремих осіб або груп.
(11) Особи, які класифікуються під МКФ, можуть у будь-який спосіб відрізнятися. Закони та положення, що стосуються класифікації МКФ, не повинні мати більше однорідності, ніж передбачалося, і повинні забезпечити, щоб ті, чиї рівні функціонування класифікувалися, розглядалися як особи.